育休中の年末調整の基本ルールから控除最大化まで実務事例と書き方を徹底解説

育児休業中でも年末調整は必要なのか、控除や扶養の判定はどうなるのか――。「手続きが複雑で間違えたら損しそう」「給与が0円でも申告は必要？」と不安を抱えていませんか。

実は、育休・産休中でも在籍していれば年末調整の対象となり、給与支給の有無や給付金の非課税扱いによって記入方法や控除額が大きく変わります。【令和7年の改正】で配偶者特別控除の所得基準が123万円に引き上げられ、「基礎控除」も95万円へ拡大。この変化で、控除の適用範囲が広がり、還付金のチャンスも増えています。

育休中の年末調整で「損をしない」ための3ステップ判定方法や、給与0円・賞与支給時の特例処理、非課税給付金の扱いまで具体例で徹底解説。さらに、住宅ローンや保険料控除の活用、夫婦どちらの扶養に入るべきかなど、共働き家庭にも役立つ情報を最新データとともにご案内します。

「このまま手続きを放置すると、本来受け取れるはずの控除や還付金を逃す可能性も…」。最後まで読むことで、あなたのケースに合った正しい対応方法や、最大限の節税メリットが明確になります。

育休中 年末調整の基本ルールと対象判定基準 – 必要か確認する3ステップ

育休中でも年末調整が必要かは、在籍状況や収入の有無によって異なります。まず、会社に在籍している場合は原則として年末調整の対象となります。次に、給与の支給があるかどうかを確認しましょう。育児休業給付金や出産手当金などの給付金は非課税扱いのため、給与所得には含まれません。最後に、控除対象となる保険料や住宅ローンなどの有無を確認することで、年末調整で税金が戻ってくるかを判断できます。

必要かどうかを確認する3ステップ

1. 会社に在籍しているか確認
2. 年内に給与や賞与の支給があるか確認
3. 控除対象となる保険料、住宅ローンの有無を確認

これらの条件を満たしていれば、育休中であっても年末調整を受けることができます。

給与0円の場合の年末調整対応 – 育休中 年末調整 0円 書き方

育休中で1年間の給与が0円の場合、原則として年末調整の対象外となります。ただし、会社から書類提出を求められた場合や途中で給与支給があった場合は記入が必要です。申告書の「給与所得」欄には0円と明記し、非課税の育児休業給付金や出産手当金は記載しません。扶養や配偶者控除の判定では、所得が0円であれば条件を満たす場合が多いので、配偶者の年末調整や扶養控除の申請が可能です。

提出が必要な主な書類

• 基礎控除申告書：合計所得金額を0円と記入
• 配偶者控除等申告書：配偶者の所得を記入
• 扶養控除等申告書：該当する扶養親族の情報を記入

これらの書類は会社の人事担当に確認し、郵送やオンラインで提出しましょう。

賞与支給のみの場合の特例処理

育休中でも賞与（ボーナス）のみ支給された場合、その金額が課税対象となります。この場合は、賞与分について源泉徴収票が発行され、年末調整の対象となります。賞与が1回でも支給されていれば、各種控除の適用や還付金が発生する可能性があります。

賞与支給時の注意点

• 賞与の支給額を「給与所得」として記載
• 控除申告書に必要事項を正確に記入
• 賞与分の社会保険料控除も忘れず申告

控除額や還付金は賞与額や支払時期により変動しますので、詳細は会社の担当者や税理士に相談してください。

産休移行時の年末調整タイミング

産休から育休に移行する場合、年末調整のタイミングに注意が必要です。産休期間中に給与や手当が支給された場合は、年末調整の対象となります。産休と育休をまたぐ場合は、産休終了時点の給与支給状況を確認し、必要な控除申告書を提出しましょう。

ポイント

• 産休中の給与や手当の有無を確認
• 申告書の記載内容を産休・育休の状況に合わせて調整
• 出産手当金や育児休業給付金は非課税で申告不要

年末調整の対象かどうか迷う場合は、勤務先の人事・労務担当や税理士に相談し、正確に手続きを進めることが重要です。

育休中 年末調整 書き方の完全ガイド – 基礎控除申告書から記入例

育休中で給与が発生していない場合も、年末調整の書類提出は必要です。特に基礎控除申告書や配偶者控除申告書、保険料控除申告書などの記入内容が重要です。育児休業給付金や出産手当金は非課税なので給与所得に含めず、必要な控除をもれなく申請しましょう。会社が年末調整をしてくれるケースが多いですが、不明点は必ず人事や労務担当者に確認してください。控除の種類によっては還付金が戻る場合がありますので、手続きを確実に行うことが大切です。

必要書類	ポイント
基礎控除申告書	所得がなければ「0円」と記入
配偶者控除申告書	配偶者の所得見積と控除要件を確認
扶養控除等（異動）申告書	子どもや親の情報を記載し、異動がある場合は理由も記入
保険料控除申告書	支払証明書を添付し、生命保険や社会保険料を記入
住宅ローン控除申告書	年末残高証明書を添付し、該当者は必ず提出

給与所得欄の記入方法 – 育休中 年末調整 給与所得 書き方

育休中で給与の支給がない場合、給与所得欄には「0円」と記入します。育児休業給付金や出産手当金は非課税収入のため給与所得には含めません。副業など他に所得がある場合は、その合計所得額を計算し、正確に記入してください。
給与所得が0円の場合でも基礎控除は全額適用されるため、控除枠を最大限活用できます。会社から送付された書類に従い、必要な項目をもれなく記入し提出しましょう。

賞与・通勤手当の合算処理

育休開始前に賞与や通勤手当を受け取っている場合、それらは年末調整の給与所得に合算されます。
下記の流れで処理します。

1. 年間の給与収入に賞与や通勤手当を加算
2. 支給明細や源泉徴収票をもとに合計額を記載
3. 育児休業給付金などは含めない

この合算処理により正確な所得額が算出され、控除額や還付金の判断材料となります。手当の内訳をしっかり確認し、必要な証明書類もあわせて提出しましょう。

妻側申告の注意点 – 育休中 年末調整 書き方 妻

妻が育休中で収入がない場合は、夫の年末調整で配偶者控除を申告できる場合があります。配偶者の所得が48万円以下であれば、配偶者控除が適用され、夫の税負担が軽減されます。
記入の際は、妻の年間所得を正確に「0円」とし、配偶者控除申告書の該当欄に記載してください。扶養控除や社会保険料控除も忘れずに入力しましょう。
妻自身が住宅ローン控除や保険料控除を受ける場合は、必要書類を添付し、自身の年末調整書類に正しく記入することが重要です。会社や税理士に確認しながら、ミスのない手続きを心がけてください。

非課税給付と年末調整の関係 – 出産手当金・育児休業給付金除外ルール

育休中に支給される出産手当金や育児休業給付金は、所得税の計算に含まれない非課税所得です。年末調整の際、これらの給付金は給与所得や収入として計上しないため、課税対象となる所得が少なくなります。その結果、各種控除（基礎控除・配偶者控除・扶養控除・保険料控除など）の適用を最大限活用できるケースが多くなります。特に育休中で給与収入がない場合でも、年末調整の申告は必要です。会社から送付される申告書に「収入なし」「0円」と記載し、必要書類を提出することで、還付金が戻る可能性があります。

出産手当金・出産育児一時金の扱い

出産手当金や出産育児一時金は、法令で非課税とされています。これらは給与所得や事業所得には該当せず、年末調整の対象外となります。年末調整の申告書には「出産手当金」「出産育児一時金」の受給額を記載する必要はありません。給付を受けても他の所得や控除の判定には影響しないため、安心して受給できます。また、これらの給付は扶養や配偶者控除の判定にも影響がありません。

育児休業給付金の2年目継続時

育児休業給付金は原則として最長2年間支給され、2年目も同様に非課税として扱われます。2年目以降も給与支給がなければ、前年と同様に年末調整で給与所得「0円」と記載します。2年目も扶養や配偶者控除、保険料控除の条件を満たす場合は、引き続き控除が適用されます。会社から案内された申告書に正確に記入し、書類を期限内に提出することが大切です。

社会保険料免除との連動効果

育休中は社会保険料（健康保険・厚生年金）の支払いが免除される制度があります。社会保険料が免除されることで手取り額が増え、家計の負担軽減につながります。免除期間中も保険の加入期間としてカウントされ、将来の年金受給資格や医療保険の給付には影響しません。年末調整では社会保険料控除の対象外となりますが、民間の生命保険料や地震保険料などは引き続き控除として申告可能です。保険料控除証明書は忘れずに添付しましょう。

育休中 年末調整 控除最大化戦略 – 保険料・住宅ローン・配偶者控除

育休中でも年末調整をしっかり活用することで、所得税の負担を大幅に軽減できます。会社が年末調整を実施する際は、保険料控除や住宅ローン控除、配偶者控除などの提出書類や記入方法に注意し、適切な控除をもれなく申告することが重要です。特に収入が0円となる場合でも、基礎控除や扶養控除の判定に影響し、還付金が戻るケースもあります。保険料控除や配偶者控除は、夫婦双方の所得状況により申告先が変わるため、事前に確認しておきましょう。

生命保険料控除の有効活用 – 育休中 生命保険料控除 意味 ないの誤解解消

育休中でも生命保険料控除は有効です。給与が0円となっても、年末調整で保険料控除申告書を提出することで過去の源泉徴収額から還付を受けられます。控除額は支払った保険料に応じて最大12万円まで適用されるため、家計の節税効果は大きいです。

保険種類	年間支払額	最大控除額
生命保険料	8万円超	4万円
介護医療保険料	8万円超	4万円
個人年金保険料	8万円超	4万円

生命保険料控除は「意味ない」と誤解されがちですが、実際は収入がない年ほど控除効果が高まることもあります。証明書の添付を忘れず、記入漏れに注意しましょう。

地震保険料控除の併用例

地震保険料控除も併用可能です。地震保険に加入している場合、年末調整で地震保険料控除申告欄に支払額を記入し、証明書を添付することで最大5万円まで所得控除が受けられます。生命保険料控除と併用することで、さらに節税効果を高めることができます。

控除項目	支払額上限	最大控除額
地震保険料	5万円超	5万円

地震保険料控除は、保険料証明書の提出も必須です。忘れずに確認しましょう。

住宅ローン控除継続の条件 – 育休中 年末調整 住宅ローン控除

育休中でも住宅ローン控除は継続して適用されます。年末調整時に住宅借入金等特別控除申告書と銀行などからの残高証明書を提出しましょう。育休中であっても、前年の適用を受けていれば、引き続き控除が受けられます。収入が減少した場合でも、控除額はローン残高の1%が適用されるため、家計負担を抑えるポイントです。

必要書類	主な内容
住宅借入金等特別控除申告書	住宅ローンの残高記入
残高証明書	金融機関発行・年末残高が必要

転職や復職後も控除が継続できるよう、毎年の手続きを忘れないことが大切です。

公務員・夫婦ペアローンの特例

公務員でも住宅ローン控除の申請は可能で、勤務先で年末調整を受けられます。また、夫婦ペアローンの場合は、それぞれが借入残高に応じて控除を受けることができます。住宅を共有名義で購入しているケースでは、持分割合を正しく申告することが重要です。

公務員は所属部署の指示に従い、申告書類を提出しましょう。夫婦で控除を受ける場合は、各自が必要書類を会社へ提出する必要があります。

配偶者特別控除の所得壁緩和 – 令和7年改正123万円基準

令和7年（2025年）から配偶者特別控除の所得基準が123万円に引き上げられます。これにより、育休中で一時的に所得が減少した場合でも、配偶者控除や配偶者特別控除を活用しやすくなります。

配偶者の合計所得金額	控除額
48万円以下	38万円
48万円超123万円以下	36～3万円

配偶者控除・特別控除の申告では、配偶者の収入・所得を正確に計算し、扶養判定や控除申告をミスなく行うことがポイントです。扶養の可否や控除額は毎年変わるため、最新の基準を確認しながら手続きを進めましょう。

育休中 年末調整 扶養・配偶者控除の実務ケース – 夫婦別シミュレーション

育休中の年末調整では、扶養や配偶者控除を正しく適用することで税負担を軽減できます。特に夫婦どちらが育休を取るかで対応が異なり、控除の有無が還付金額や翌年の税金に大きく影響します。以下、実務で迷いやすいケースを具体的に解説します。

妻の育休中 – 夫の年末調整への影響

妻が育休中は給与収入がゼロに近くなり、配偶者控除や配偶者特別控除の適用可否がポイントとなります。育児休業給付金や出産手当金は非課税で所得に含まれず、控除判定には影響しません。夫の年末調整では、妻の合計所得金額が48万円以下の場合に配偶者控除（最大38万円）が認められます。妻のパート収入や副業がある場合はその合計で判定されます。

控除区分	妻の所得金額	控除額	備考
配偶者控除	48万円以下	38万円	所得税で適用
配偶者特別控除	48万円超133万円以下	38～3万円	段階的に縮小

扶養未加入時の調整方法 – 育休中 配偶者控除 扶養に入っていない

妻が夫の扶養に入っていない場合でも、年末時点で条件を満たせば夫側で配偶者控除の申告が可能です。年の途中で育休に入り収入が減少し、結果的に所得基準を下回れば、年末調整で修正できます。控除適用のためには、妻の収入証明や所得見積額を正確に把握し、配偶者控除申告書に正しい金額を記入することが重要です。

• 妻の給与が年途中で0円になった場合も、年末時点の合計所得額で判定
• 夫の会社に「配偶者控除等申告書」を提出
• 妻の所得証明や源泉徴収票のコピーを求められることがある

夫の扶養入りタイミング – 育休中 夫の扶養に入る 年末調整 書き方

育休中に夫の扶養へ切り替える場合、切り替えのタイミングは年末調整時点で判断されます。育休前に扶養に入っていなくても、年末時点で所得が基準以下ならその年から扶養に入ることができます。申告書には「合計所得金額0円」や「収入なし」と記載し、会社へ提出します。必要に応じて、夫の会社に扶養異動届も提出しましょう。

• 年末調整時点で扶養判定
• 会社に「給与所得者の扶養控除等（異動）申告書」を提出
• 扶養切り替えの事実を早めに会社へ連絡

配偶者特別控除階層別還付額

配偶者の所得が48万円を超えた場合は、配偶者特別控除が適用されます。所得階層により控除額が細かく設定されているため、還付額も異なります。

配偶者の所得金額	控除額（所得税）
48万円超 95万円以下	38万円
95万円超100万円以下	36万円
100万円超105万円以下	31万円
105万円超110万円以下	26万円
110万円超115万円以下	21万円
115万円超120万円以下	16万円
120万円超125万円以下	11万円
125万円超130万円以下	6万円
130万円超133万円以下	3万円

この仕組みにより、育休中でもパート収入などがある場合は控除額が段階的に減少します。

共働き家庭のデメリット回避

共働き家庭では、育休中の配偶者控除や扶養判定を誤ると税負担が増えるリスクがあるため注意が必要です。特に妻が育休に入り収入が減ったタイミングで適切な申告を行うことで、控除の恩恵を最大限受けられます。

• 妻の所得が48万円以下かをしっかり確認
• 夫婦双方で年末調整の申告書内容を照合
• 控除適用に漏れがないか会社へ早めに相談

正しい申告で、育休中も家計の税負担を抑えることが可能です。

会社対応トラブル解決 – 育休中 年末調整 会社がやってくれない時の対処

育休中に会社が年末調整をしてくれない場合、まずは人事・労務担当者へ連絡し、状況の確認を行いましょう。多くの場合、育休中の従業員も在籍扱いとなり、会社が年末調整を行う義務があります。しかし、会社側の対応漏れや書類のやり取りが郵送で遅れるケースも見受けられます。その際は、書類の提出方法や期限について再確認し、必要書類（扶養控除等申告書、保険料控除申告書、住宅ローン控除申告書など）を揃えて速やかに提出してください。

年末調整に間に合わない場合や、会社が対応を拒否する場合は、ご自身で確定申告を行うことで、適切な控除を受け還付金を受け取ることが可能です。会社対応が難しい場合の早期の切り替えが重要です。

会社拒否時の確定申告切り替え

会社が年末調整を実施しない場合は、確定申告による対応が有効です。確定申告では、育休中に支払った社会保険料や生命保険料、住宅ローン控除などを正確に申告することで、税金の還付を受けることができます。特に、育児休業給付金は非課税ですが、給与収入が0円の場合でも各種控除を申告することで還付対象となります。

確定申告の際には、源泉徴収票が必要となるため、会社から取得できるか早めに確認しましょう。以下の書類を用意してください。

• 源泉徴収票
• 扶養控除等申告書の控え
• 生命保険料控除証明書
• 住宅ローン控除証明書
• 社会保険料の支払い証明

還付金請求の期限・方法

確定申告による還付金の請求は、還付を受ける年の翌年2月16日から3月15日までが一般的な申告期間です。ただし、還付申告の場合は5年間提出が可能です。申告書は税務署に持参、郵送、またはe-Taxでの電子申告が利用できます。

還付金の受取は、申告後1〜2ヶ月程度で指定口座に振り込まれます。書類不備や記載ミスを防ぐため、事前に必要書類をチェックすることが大切です。

項目	内容
還付申告期間	翌年2月16日～3月15日（還付のみ5年可）
必要書類	源泉徴収票、各種控除証明書
提出方法	税務署持参・郵送・e-Tax
還付までの期間	申告後1～2ヶ月

人事担当者向けチェックリスト

育休中の従業員へ年末調整を円滑に進めるためには、次のポイントを確実に押さえてください。

• 育休中社員への年末調整案内の送付
• 申告書類（扶養控除等申告書・基礎控除申告書等）の配布
• 郵送やオンライン提出の受付体制の整備
• 提出期限の明確化とリマインド
• 不明点への迅速な対応

これらを徹底することで、育休中でも従業員が不利益を被らず、会社側も税務リスクを回避できます。年末調整に関する社内FAQやサポート体制の充実も推奨されます。

令和7年年末調整改正の育休中影響 – 基礎控除UPと特定親族特別控除

令和7年の年末調整改正では、基礎控除額が引き上げられ、配偶者控除や扶養控除の適用基準も緩和されます。育休中で収入が大きく減少またはゼロの場合、これらの控除を最大限活用しやすくなります。特に、育児休業給付金や出産手当金は非課税扱いとなるため、所得金額が低く算出され、控除の恩恵を受けやすくなっています。企業や人事担当者は、書類の案内と提出期限の明確化を徹底し、従業員が不利益を被らないようサポートが重要です。

123万円壁緩和の具体効果

123万円壁の緩和により、配偶者の年間所得が103万円を超えても最大123万円まで配偶者控除の対象となります。育休中は給与がゼロ、または大幅減となるため、夫の年末調整で配偶者控除を申告しやすくなります。これにより、税負担が軽減され、家計への還元効果も高まります。

控除名	所得上限	主な効果
配偶者控除	123万円まで	所得税が約4万円軽減
基礎控除	48万円	所得が少ない人も全額適用可能
扶養控除	子1人38万円	扶養親族がいる場合に有効

定額減税廃止後の調整

定額減税が廃止された影響で、年末調整時に一時的な減税措置がなくなりました。しかし、基礎控除や配偶者控除が拡充されたため、育休中の所得が少ない家庭でもしっかりと還付金を受け取れます。還付額が以前より明確になり、計算がシンプルになったというメリットもあります。

新書式一本化の記入変更点

令和7年から年末調整書類が一本化され、「基礎控除申告書」と「配偶者控除等申告書」が統合されました。育休中に記入する場合、収入欄は0円と明記し、配偶者や扶養家族の状況を正しく記入することがポイントです。

• 収入なしの場合は「給与所得　0円」と記載
• 配偶者控除を申告する際は夫婦いずれかが正確に申告
• 証明書類（保険料控除、住宅ローン控除など）は必ず添付

書類提出は会社に郵送でも問題ありません。提出忘れを防ぐため、早めの準備が推奨されます。

来年収入見込みの申告影響

育休から復帰後の収入見込みも年末調整に影響します。来年の収入が増加した場合、扶養や配偶者控除の適用範囲が変わる可能性があるため注意が必要です。収入見積額はできるだけ正確に記載し、不明な場合は人事や税理士へ相談するのが安心です。

育休中は所得が少ないため還付額が高くなることもありますが、翌年以降の所得見込も考慮して記入することで、控除の適用ミスを防げます。各種控除を最大限に活用し、家計の負担を軽減しましょう。

育休中 年末調整の実践Q&A – 還付金・控除の現場疑問50選

育休中でも年末調整は必要？その理由と対象者のポイント

育休中でも年末調整の手続きは必要です。理由は、育児休業給付金や出産手当金は非課税ですが、会社から少しでも給与や賞与が支給された場合、正確な所得税計算と控除適用が求められるからです。会社が年末調整をしてくれない場合は、自分で確定申告を行う必要があります。

年末調整が必要なケース

• 育休中に給与が少額でも支給されている
• 住宅ローン控除や生命保険料控除、配偶者控除などを受けたい
• 社会保険料や扶養控除等の変更がある

給与が0円の場合でも、控除申告のため書類提出を会社に確認しましょう。

育休中 年末調整の書き方と必要書類

育休中の年末調整では、主に下記の書類が必要です。記入例やポイントを表で整理します。

書類名	記入ポイント	注意点
扶養控除等申告書	家族構成、収入状況を正しく記入	異動があった場合は記載
基礎控除・配偶者控除申告書	収入が0円なら「0」と明記	配偶者の収入も要確認
保険料控除申告書	支払った金額・証明書を添付	控除証明書は必須
住宅ローン控除申告書	年末残高証明を記入	ペアローンや公務員も適用可能

記入のポイント

• 育児休業給付金は非課税のため収入欄に含めない
• 配偶者控除や扶養控除の条件を満たすか確認
• 書類の提出は郵送や会社の指示に従う

育休中の控除と還付金の目安

育休中は所得が減るため、各種控除が有利に働きます。主な控除と還付金の目安をまとめます。

控除項目	内容	還付例（目安）
基礎控除	収入なしで全額適用	所得税0円に
配偶者控除	配偶者の年収103万円以下	最大約4万円減税
扶養控除	子や親が対象	一人あたり38万円控除
生命保険料控除	生命・地震保険	最大12万円控除
住宅ローン控除	年末残高の1%	数万円の還付

受けられる控除を見逃さず全て申告することで、数万円単位の還付や減税が期待できます。

育休中によくある年末調整の疑問Q&A

• 育休中でも会社は年末調整をしてくれる？
  多くの場合、会社が手続きを行います。会社が対応しない場合は確定申告が必要です。

• 育児休業給付金は年収に含める？
  含めません。非課税収入のため、所得や控除判定には計上しません。

• 配偶者控除や扶養控除の条件は？
  配偶者や扶養家族の所得要件を満たす必要があります。収入が0円ならほぼ条件を満たします。

• 住宅ローン控除は育休中も受けられる？
  受けられます。控除証明書など必要書類を忘れず提出してください。

• 還付金はいつ戻る？
  年末調整後、最終給与や指定口座に数週間以内に振り込まれるのが一般的です。

このように、育休中の年末調整では控除や還付のポイントを押さえることが大切です。自身の状況に合わせてしっかり手続きを進めましょう。